祖母绿的价值是依据颜色、纯净度和大小来定，最好的颜色是很浓的颜色。判断祖母绿的品质最重要的是色泽，翠绿通透，色泽鲜艳纯正的一定是上品，但是要避免油浸。通常，祖母绿的质地有“羽翼纹”，就像苍蝇翅膀纹一样，呈透明的冰裂纹状态。肉眼可见宝石中含有一些反白光的愈合裂隙面和白色方解石或黑色炭质包裹体，用20倍放大镜观察还可以见到锯齿型气-液-固三相流体包裹体，有时还可见到半透明的褐色短柱状氟碳钙锶矿包裹体。

大而清澈无瑕的祖母绿是十分难得的。几乎很难找得到无瑕的祖母绿。实际上，祖母绿中一定或多或少的有裂缝及内含物，其裂缝内含物种类之多之复杂，甚至被研究者称为“花园”。内含物太多自然会影响宝石的价值，但祖母绿的内含物是不可多得的样本，行家们可以轻而易举地根据这些不同的内含物分辨出不同产地及其生长环境。所以，虽然祖母绿的内含物会大大影响了宝石的美观，但其优美的绿色仍无其他宝石可以匹敌。哥伦比亚祖母绿一般多呈翠绿色，透明，具有玻璃光泽，她的—个重要特征是三相包体，即：固、液和气态。祖母绿的绿色来自其内的铬离子，可以用查尔斯滤色镜观察到。在查尔斯滤色镜下，由于铬离子的存在，大部分祖母绿会呈现暗红色，其他绿色代用品则大多呈现暗绿色。人们形容最好的绿宝石时说：“它好像能滴出油来。”只要瑕疵不严重影响宝石的颜色和透明度，都是可接受的。

值得注意的是，没有裂纹的祖母绿少之又少，市场上通常不会有售，所以如果你手中有一颗毫无裂纹的祖母绿，基本上只有两种可能：第一，恭喜你，那是遗落在世间的无价之宝；第二，很不幸，你拥有的只是绿柱石拼合的三层石！